Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cep170bQ80U49 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cep170bQ80U49 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cep170bQ80U49 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms