Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cul9Q80TT8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cul9Q80TT8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cul9Q80TT8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Cul9Q80TT8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cul9Q80TT8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms