Protein–RNA interactions for Protein: Q80TN7

Nav3, Neuron navigator 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nav3Q80TN7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nav3Q80TN7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nav3Q80TN7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nav3Q80TN7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nav3Q80TN7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nav3Q80TN7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nav3Q80TN7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nav3Q80TN7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nav3Q80TN7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nav3Q80TN7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nav3Q80TN7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nav3Q80TN7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nav3Q80TN7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nav3Q80TN7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nav3Q80TN7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nav3Q80TN7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nav3Q80TN7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nav3Q80TN7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nav3Q80TN7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Nav3Q80TN7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nav3Q80TN7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nav3Q80TN7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nav3Q80TN7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nav3Q80TN7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nav3Q80TN7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nav3Q80TN7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nav3Q80TN7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nav3Q80TN7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Nav3Q80TN7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nav3Q80TN7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nav3Q80TN7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nav3Q80TN7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nav3Q80TN7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Nav3Q80TN7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nav3Q80TN7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms