Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cdc42bpbQ7TT50 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdc42bpbQ7TT50 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms