Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sgo2Q7TSY8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms