Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctdp1Q7TSG2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctdp1Q7TSG2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms