Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ShprhQ7TPQ3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ShprhQ7TPQ3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms