Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Prrc2bQ7TPM1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prrc2bQ7TPM1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms