Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms