Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sbno2Q7TNB8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sbno2Q7TNB8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms