Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HhipQ7TN16 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms