Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
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Vma21Q78T54 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vma21Q78T54 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Vma21Q78T54 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Vma21Q78T54 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Vma21Q78T54 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Vma21Q78T54 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Vma21Q78T54 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vma21Q78T54 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vma21Q78T54 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Vma21Q78T54 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vma21Q78T54 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vma21Q78T54 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vma21Q78T54 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vma21Q78T54 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vma21Q78T54 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vma21Q78T54 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vma21Q78T54 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vma21Q78T54 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vma21Q78T54 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vma21Q78T54 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vma21Q78T54 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Vma21Q78T54 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vma21Q78T54 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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