Protein–RNA interactions for Protein: Q78J03

Msrb2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb2Q78J03 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msrb2Q78J03 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msrb2Q78J03 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms