Protein–RNA interactions for Protein: Q78EE2

Gm21292, Predicted gene, 21292, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21292Q78EE2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21292Q78EE2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21292Q78EE2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21292Q78EE2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21292Q78EE2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21292Q78EE2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21292Q78EE2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21292Q78EE2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21292Q78EE2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21292Q78EE2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21292Q78EE2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21292Q78EE2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21292Q78EE2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21292Q78EE2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21292Q78EE2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21292Q78EE2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21292Q78EE2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21292Q78EE2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21292Q78EE2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21292Q78EE2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21292Q78EE2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21292Q78EE2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21292Q78EE2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms