Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cd3eapQ76KJ5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd3eapQ76KJ5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms