Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssh1Q76I79 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ssh1Q76I79 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms