Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ncapd3Q6ZQK0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms