Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ino80Q6ZPV2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ino80Q6ZPV2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms