Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc88cQ6VGS5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc88cQ6VGS5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms