Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Casc1Q6TDU8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Casc1Q6TDU8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms