Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc154Q6RUT8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc154Q6RUT8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc154Q6RUT8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc154Q6RUT8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc154Q6RUT8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc154Q6RUT8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc154Q6RUT8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc154Q6RUT8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc154Q6RUT8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc154Q6RUT8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc154Q6RUT8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc154Q6RUT8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc154Q6RUT8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc154Q6RUT8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc154Q6RUT8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc154Q6RUT8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc154Q6RUT8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc154Q6RUT8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc154Q6RUT8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc154Q6RUT8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc154Q6RUT8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc154Q6RUT8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc154Q6RUT8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc154Q6RUT8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc154Q6RUT8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc154Q6RUT8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc154Q6RUT8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms