Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGD0

Atraid, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtraidQ6PGD0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtraidQ6PGD0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtraidQ6PGD0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtraidQ6PGD0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtraidQ6PGD0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtraidQ6PGD0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtraidQ6PGD0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtraidQ6PGD0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtraidQ6PGD0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtraidQ6PGD0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtraidQ6PGD0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtraidQ6PGD0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtraidQ6PGD0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtraidQ6PGD0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtraidQ6PGD0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtraidQ6PGD0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AtraidQ6PGD0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AtraidQ6PGD0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AtraidQ6PGD0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AtraidQ6PGD0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AtraidQ6PGD0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtraidQ6PGD0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtraidQ6PGD0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AtraidQ6PGD0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtraidQ6PGD0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtraidQ6PGD0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtraidQ6PGD0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtraidQ6PGD0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtraidQ6PGD0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtraidQ6PGD0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtraidQ6PGD0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtraidQ6PGD0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AtraidQ6PGD0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtraidQ6PGD0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtraidQ6PGD0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtraidQ6PGD0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtraidQ6PGD0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtraidQ6PGD0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtraidQ6PGD0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtraidQ6PGD0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtraidQ6PGD0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtraidQ6PGD0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtraidQ6PGD0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtraidQ6PGD0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms