Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf1cQ6PDZ2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms