Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Gapvd1Q6PAR5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Gapvd1Q6PAR5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Gapvd1Q6PAR5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms