Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BC061212Q6P8K3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC061212Q6P8K3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms