Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Slx4Q6P1D7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Slx4Q6P1D7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms