Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms