Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZA9

Taf9b, Transcription initiation factor TFIID subunit 9B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf9bQ6NZA9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf9bQ6NZA9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms