Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pdcd11Q6NS46 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pdcd11Q6NS46 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms