Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg16l2Q6KAU8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg16l2Q6KAU8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg16l2Q6KAU8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg16l2Q6KAU8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg16l2Q6KAU8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg16l2Q6KAU8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg16l2Q6KAU8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg16l2Q6KAU8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg16l2Q6KAU8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg16l2Q6KAU8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg16l2Q6KAU8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg16l2Q6KAU8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg16l2Q6KAU8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg16l2Q6KAU8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg16l2Q6KAU8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg16l2Q6KAU8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg16l2Q6KAU8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Atg16l2Q6KAU8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Atg16l2Q6KAU8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg16l2Q6KAU8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms