Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capn11Q6J756 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms