Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt40Q6IFX3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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