Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Carmil1Q6EDY6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Carmil1Q6EDY6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Carmil1Q6EDY6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms