Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.85
Smarca2Q6DIC0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Smarca2Q6DIC0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Smarca2Q6DIC0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Smarca2Q6DIC0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms