Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nop58Q6DFW4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nop58Q6DFW4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms