Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

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Length 675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pram1Q6BCL1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pram1Q6BCL1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pram1Q6BCL1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms