Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rftn1Q6A0D4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rftn1Q6A0D4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms