Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cep170Q6A065 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cep170Q6A065 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cep170Q6A065 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cep170Q6A065 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Cep170Q6A065 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Cep170Q6A065 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cep170Q6A065 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Cep170Q6A065 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cep170Q6A065 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Cep170Q6A065 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cep170Q6A065 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cep170Q6A065 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Cep170Q6A065 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cep170Q6A065 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cep170Q6A065 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cep170Q6A065 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms