Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Pkp4Q68FH0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Pkp4Q68FH0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Pkp4Q68FH0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp4Q68FH0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
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Pkp4Q68FH0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Pkp4Q68FH0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Pkp4Q68FH0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Pkp4Q68FH0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Pkp4Q68FH0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pkp4Q68FH0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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