Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Surf4Q64310 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Surf4Q64310 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms