Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nhlh2Q64221 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nhlh2Q64221 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms