Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col4a5Q63ZW6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Col4a5Q63ZW6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms