Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sp4Q62445 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp4Q62445 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms