Protein–RNA interactions for Protein: Q62261

Sptbn1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn1Q62261 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sptbn1Q62261 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sptbn1Q62261 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sptbn1Q62261 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms