Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Sall3Q62255 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sall3Q62255 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Sall3Q62255 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms