Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Six3Q62233 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Six3Q62233 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Six3Q62233 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Six3Q62233 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Six3Q62233 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Six3Q62233 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Six3Q62233 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Six3Q62233 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six3Q62233 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six3Q62233 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six3Q62233 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms