Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms