Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms