Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msi1Q61474 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msi1Q61474 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms