Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccne1Q61457 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccne1Q61457 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccne1Q61457 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccne1Q61457 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccne1Q61457 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccne1Q61457 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccne1Q61457 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccne1Q61457 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccne1Q61457 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccne1Q61457 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccne1Q61457 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccne1Q61457 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccne1Q61457 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccne1Q61457 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccne1Q61457 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccne1Q61457 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccne1Q61457 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccne1Q61457 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccne1Q61457 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccne1Q61457 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccne1Q61457 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccne1Q61457 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccne1Q61457 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms